核心學術課程：紮實基礎與多元選修

香港航海學校提供初中至高中的完整正規課程，並特別注重理論與實踐相結合：

• 初中階段（中一至中三）： 著重培養語文能力與科學創科素養。科目涵蓋中國語文、中國歷史、數學、普通電腦、公民、經濟與社會、科技與生活、體育、海事、綜合科學、視覺藝術等，同時全體學生均須修讀校本特色海事科。

• 高中階段（中四至中六）： 配合香港中學文憑考試（HKDSE）架構，除核心科目（中文、英文、數學、公民與社會發展）外，提供豐富的多元選修科目，包括：
• 資訊及通訊科技
• 旅遊與款待
• 體育
• 健康管理與社會關懷
• 視覺藝術

海事專業課程與專業認可

香港航海學校的海事課程獲香港海事處認可，是全港極少數能提供完整海事專業訓練的中學：

1. 專業資歷對接： 學生完成指定海事課程後，可直接考取本地船長三級證書等專業資歷，為日後投身海事工程、航海業、政府船隊或相關高級文憑/學位課程奠定基礎。
2. 新科技教學設施： 學校配備專業級的海事實驗室，內置大型模擬駕駛訓練系統及沉浸式虛擬實境（VR）訓練系統，讓學生在安全且逼真的環境中學習船務操作、航行導向及海事應變。